{"id":6656,"date":"2020-07-07T07:00:51","date_gmt":"2020-07-07T05:00:51","guid":{"rendered":"https:\/\/biovariance.com\/uncategorized\/validierung-von-pcr-oligos-fur-sars-cov-2-nachweis\/"},"modified":"2023-03-08T12:50:24","modified_gmt":"2023-03-08T11:50:24","slug":"validierung-von-pcr-oligos-fuer-sars-cov-2-nachweis","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/biovariance.com\/de\/projekte\/validierung-von-pcr-oligos-fuer-sars-cov-2-nachweis\/","title":{"rendered":"Validierung von PCR Oligos f\u00fcr SARS-CoV-2 Nachweis"},"content":{"rendered":"

Die globale SARS-CoV-2 Pandemie breitet sich schnell und unaufhaltsam aus. W\u00e4hrend noch an einer Impfung geforscht wird, ist eine Erh\u00f6hung der Test-Kapazit\u00e4ten von gr\u00f6\u00dfter Bedeutung, um Infektionsherde schnell zu lokalisieren und einzud\u00e4mmen. Die BioVariance GmbH hat ihren Teil dazu beigetragen, indem Sie eine weltweit agierende in-vitro<\/em> Diagnostik-Firma bei der FDA-Zulassung eines neuen und schnellen COVID-19 PCR-Tests unterst\u00fctzt hat. Dies konnte durch computergest\u00fctzte (in-silico<\/em>) Validierungsmethoden und das Engagement unseres Teams aus Daten-Spezialisten in Rekordzeit umgesetzt werden. Im Rahmen dieses Projekts konnten zwei Anforderungen der FDA (Food and Drug Administration) erf\u00fcllt werden:<\/p>\n

Sensitivit\u00e4t der Primer und Proben<\/h2>\n

Um die Sensitivit\u00e4t der Oligonukleotide des COVID-19 Tests zu best\u00e4tigen, wurden die Sequenzen mit allen \u00f6ffentlich verf\u00fcgbaren SARS-CoV-2 Sequenzen aligned. Im Anschluss wurde die Trefferliste nach Qualit\u00e4tskriterien (z. B. E-Wert) sortiert, gefiltert und beurteilt. Desweiteren wurde sichergestellt, dass die Bildung eines PCR-Produktes potentiell m\u00f6glich ist. \u00a0<\/p>\n

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Abb. 1: Alignment von SARS-CoV-2 Sequenzen.<\/figcaption><\/figure>\n

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Prognose der Kreuz-Reaktivit\u00e4t<\/h2>\n

Um eine Kreuz-Reaktivit\u00e4t vorherzusagen und m\u00f6glichst auszuschlie\u00dfen, wurden die Sequenzhomologien zwischen den Oligonukleotiden und den Genomen des Menschen, verwandten Coronaviren und Pathogenen der Atemwege ermittelt. So k\u00f6nnen potentiell falsch-positive PCR-Ergebnisse vorhergesagt werden und die Primer und Proben k\u00f6nnen optimiert werden, bevor m\u00f6glicherweise Zeit und Ressourcen im Labor verschwendet werden. \u00a0<\/p>\n

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Abb. 2: Flussdiagramm der Beurteilung von Sequenzhomologien<\/figcaption><\/figure>\n

Ihre Vorteile in der Zusammenarbeit mit uns:<\/h2>\n