{"id":6662,"date":"2020-07-23T09:14:02","date_gmt":"2020-07-23T07:14:02","guid":{"rendered":"https:\/\/biovariance.com\/uncategorized\/effektive-verarbeitung-von-daten-mit-biocore-studio\/"},"modified":"2023-03-08T12:42:27","modified_gmt":"2023-03-08T11:42:27","slug":"effektive-verarbeitung-von-daten-mit-biocore-studio","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/biovariance.com\/de\/projekte\/effektive-verarbeitung-von-daten-mit-biocore-studio\/","title":{"rendered":"Effektive Verarbeitung von Daten mit BioCore Studio"},"content":{"rendered":"

Durch die rasante Weiterentwicklung leistungsstarker Messtechnologien der Bioanalytik, wie z.B. NGS oder HPLC\/UPLC-MS, k\u00f6nnen im Hochdurchsatz komplexe Daten erzeugt werden. Damit Forschungsfragen ad\u00e4quat beantwortet werden k\u00f6nnen, ist es von gr\u00f6\u00dfter Bedeutung, versteckte Muster und Korrelationen in diesen Daten erfolgreich aufzudecken. So ist die Herausforderung in der Wissenschaft heute meist nicht die Erzeugung von ausreichend Daten, sondern deren bioinformatische Auswertung. Es ist also an der Zeit, Wissenschaftlern ein Werkzeug an die Hand zu geben, das Ihnen erlaubt, diese gro\u00dfen Datenmengen schnell und einfach zu verwalten und zu analysieren. Zu diesem Zweck arbeitet die BioVariance GmbH an der Entwicklung von BioCore Studio.<\/p>\n

Was ist BioCore Studio?<\/strong><\/h2>\n

BioCore Studio ist eine cloud-basierte Software zur Erstellung, Automatisierung und Parallelisierung von Datenanalyse-Workflows, sogenannten Pipelines, f\u00fcr die rechenintensive biomedizinische Forschung (siehe Abb. 1). \u00a0<\/p>\n

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Abb. 1: Automatisierung und Parallelisierung von Analyse-Piplines mit BioCore Studio<\/figcaption><\/figure>\n

\u00a0 Mittels einer Tool-Palette k\u00f6nnen intuitiv per \u201eDrag & Drop\u201c auf eigene Forschungsfragen zugeschnittene Analyse-Pipelines erstellt werden. Dazu sind keinerlei Programmierkenntnisse n\u00f6tig. Zudem ist BioCore Studio f\u00fcr alle Datentypen geeignet. Durch die Visualisierung des Prozessverlaufs in Echtzeit ist die Prozessierung der Daten stets transparent und gibt Einblick in die Ergebnisse jedes Einzelschrittes. Wiederkehrende Datenverarbeitungsprozesse k\u00f6nnen einfach und schnell geplant und gestartet werden. Die Software nutzt moderne Parellelisierungs- und Automatisierungstechnologien, um eine optimale Nutzung von personellen und technischen Ressourcen zu gew\u00e4hrleisten. BioCore Studio ist hinsichtlich der Rechenleistung flexibel skalierbar und passt sich den individuellen Bed\u00fcrfnissen an. Gro\u00dfe Datenmengen k\u00f6nnen so schnell und sicher verarbeitet werden. Dank des Kubernetes-Clusters k\u00f6nnen verf\u00fcgbare Rechenkapazit\u00e4ten effizient genutzt werden.<\/p>\n

Das Produkt im Einsatz<\/strong><\/h2>\n

Intern nutzt die BioVariance GmbH BioCore Studio zur Auswertung von NGS-Daten (genetische Daten) und deren Interpretation im Kundenauftrag (siehe Abb.2). Hierf\u00fcr gibt es einsatzbereite Pipelines, die kontinuierlich von der BioVariance GmbH in Bezug auf neue biomedizinische Fragestellungen erweitert und optimiert werden. \u00a0<\/p>\n

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Abb. 2: Erkennung komplexer Muster in genetischen Daten mit BioCore Studio<\/figcaption><\/figure>\n

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Vorteile mit BioCore Studio<\/strong><\/h2>\n