Durch die rasante Weiterentwicklung leistungsstarker Messtechnologien der Bioanalytik, wie z.B. NGS oder HPLC/UPLC-MS, können im Hochdurchsatz komplexe Daten erzeugt werden. Damit Forschungsfragen adäquat beantwortet werden können, ist es von größter Bedeutung, versteckte Muster und Korrelationen in diesen Daten erfolgreich aufzudecken. So ist die Herausforderung in der Wissenschaft heute meist nicht die Erzeugung von ausreichend Daten, sondern deren bioinformatische Auswertung. Es ist also an der Zeit, Wissenschaftlern ein Werkzeug an die Hand zu geben, das Ihnen erlaubt, diese großen Datenmengen schnell und einfach zu verwalten und zu analysieren. Zu diesem Zweck arbeitet die BioVariance GmbH an der Entwicklung von BioCore Studio.

Was ist BioCore Studio?

BioCore Studio ist eine cloud-basierte Software zur Erstellung, Automatisierung und Parallelisierung von Datenanalyse-Workflows, sogenannten Pipelines, für die rechenintensive biomedizinische Forschung (siehe Abb. 1).  

  Mittels einer Tool-Palette können intuitiv per „Drag & Drop“ auf eigene Forschungsfragen zugeschnittene Analyse-Pipelines erstellt werden. Dazu sind keinerlei Programmierkenntnisse nötig. Zudem ist BioCore Studio für alle Datentypen geeignet. Durch die Visualisierung des Prozessverlaufs in Echtzeit ist die Prozessierung der Daten stets transparent und gibt Einblick in die Ergebnisse jedes Einzelschrittes. Wiederkehrende Datenverarbeitungsprozesse können einfach und schnell geplant und gestartet werden. Die Software nutzt moderne Parellelisierungs- und Automatisierungstechnologien, um eine optimale Nutzung von personellen und technischen Ressourcen zu gewährleisten. BioCore Studio ist hinsichtlich der Rechenleistung flexibel skalierbar und passt sich den individuellen Bedürfnissen an. Große Datenmengen können so schnell und sicher verarbeitet werden. Dank des Kubernetes-Clusters können verfügbare Rechenkapazitäten effizient genutzt werden.

Das Produkt im Einsatz

Intern nutzt die BioVariance GmbH BioCore Studio zur Auswertung von NGS-Daten (genetische Daten) und deren Interpretation im Kundenauftrag (siehe Abb.2). Hierfür gibt es einsatzbereite Pipelines, die kontinuierlich von der BioVariance GmbH in Bezug auf neue biomedizinische Fragestellungen erweitert und optimiert werden.  

 

Vorteile mit BioCore Studio

• Modernste Parallelisierungs- und Automatisierungstechnologie (u.a. Kubernetes, Docker)
• Schnelle Prozessierung großer Datenmengen
• Benutzerfreundliche, intuitive Oberfläche
• Keine Programmierkenntnisse erforderlich
• Nutzbar für sämtliche Dateiformate ohne Konvertierung
• Transparente Prozessnachverfolgung
• Skalierbar für die effiziente Nutzung von Rechenkapazitäten
• Ready-to-go Pipelines
• Implementierung von maßgeschneiderten Tools möglich

BioCore Studio macht modernste Computer-Technologien für Wissenschaftler effektiv nutzbar.

  Kontaktperson:  Helen Rießbeck | Vertrieb Email: helen.riessbeck@biovariance.com